Приложение обеспечивает визуальное представление таблиц базы данных, видов, хранимых процессов и внешних ключей. Кроме того, оно может синхронизировать модель разработки с фактической базой данных.
MySQL Workbench может также создавать необходимые скрипты для создания базы данных, созданные в эскизах. Она совместима с моделями баз данных DBDesigner 4 и поддерживает новые функции по MySQL 5.